马达加斯加独天独厚的环境成为动植物天堂，然而人类2000年来的耕作活动，使得这块神奇的土地上的许多物种走向消失。为了保护这些独有的动植物，马达加斯加规划出了25个国家公园和15个特别保护区。
国家公园：25个
西北部：Parc National Montagne d’Ambre（Amber Mountain National Park 琥珀山）
东部：Parc National Mantadia（Andasibe-Mantadia National Park曼塔迪亚）
西北部：Parc National Ankarafantsika（Ankarafantsika National Park 安卡拉凡茲卡）
南部：Parc National Andohahela（Andohahela National Park 安多亚耶拉）
中部高原：Parc National Analamazaotra（Analamazaotra National Park）
东南部：Parc National Andringitra（Andringitra National Park 安德立吉塔）
西北部：;Parc National Baie de Baly（Baie de Baly National Park）
南部：Parc National Isalo（Isalo National Park 伊萨鲁）
西部：Parc National Kirindy Mite（Kirindy Mitea National Park 南-奇灵地）
西北部：Parc National Lokobe（Lokobe National Park 诺西贝岛上的国家公园）
东部：Parc National Mananara Nord（Mananara Nord National Park马纳纳拉）
东北部：Parc National Marojejy（Marojejy National Park 马如杰）
东北部：Parc National Masoala – Nosy Mangabe（Masoala National Park 马苏阿拉）
西北部：Parc National Marin Nosy Hara（Marin Nosy Hara National Park）
东部：Parc National Marolambo（Marolambo National Park）
西北部：Parc National Marin Nosy Tanikely（Marin Nosy Tanikely National Park）
南部：Parc National Mikea（Mikea National Park）
东南部：Parc National Midongy du Sud（Midongy du sud National Park）
南部：Parc National Nosy Ve – Androka（Nosy Ve – Androka National Park）
东南部：Parc National Ranomafana（Ranomafana National Park哈努马法纳）
西北部：Parc National Sahamalaza（Sahamalaza National Park）
南部：Parc National Tsimanapesotse（Tsimanampetsotsa National Park 齐马南佩楚察）
西北部：Parc National Tsingy de Namoroka（Tsingy de Namoroka National Park）
西部：Parc National Bemaraha（Tsingy de Bemaraha National Park 贝马拉哈）
东部：Parc National Zahamena（Zahamena National Park）
南部：Parc National Zombitse Vohibasia（Zombitse-Vohibasia National Park 宗比特）
特别保护区：15个
西北部：Réserve Spéciale Ankarana（Ankarana Reserve 安卡拉那）
东部：Réserve Spéciale Ambatovaky（Ambatovaky Reserve）
中部高原：Réserve Spéciale Ambohitantely（Ambohitantely Reserve）
东北部：Réserve Spéciale Anjanaharibe-Sud（Anjanaharibe-Sud Reserve）
西部：Réserve Spéciale Andranomena（Andranomena Reserve）
西北部：Réserve Spéciale Analamerana（Analamerana Reserve）
南部：Réserve Spéciale Beza Mahafaly（Beza Mahafaly Reserve）
东部：Réserve Naturelle Intégrale Betampona（Betampona Integral Reserve）
南部：Réserve Spéciale Cap Sainte-Marie（Cap Sainte Marie special reserve 圣玛丽岬）
南部：Réserve Spéciale Kalambatritra（Kalambatritra Reserve）
东南部：Réserve Spéciale Manombo（Manombo Reserve）
西北部：Réserve Spéciale Manongarivo（Manongarivo Reserve）
东部：Réserve Spéciale Mangerivola（Mangerivola Reserve）
东部：Réserve Spéciale Marotandrano（Marotandrano Reserve）
东南部：Réserve Spéciale Pic d’Ivohibe（Pic d’Ivohibe Reserve）
西北部：Réserve Naturelle Intégrale Tsaratanana（Tsaratanana Integral Reserve）
